Una variante ha modificato il percorso da via I Settembre in poi: secondo il progetto iniziale la linea avrebbe dovuto percorrere questa via fino corso Garibaldi per poi raggiungere viale della Libertà passando da viale Giostra e via Pola. Tale soluzione fu fortemente osteggiata in quanto secondo alcuni avrebbe impedito lo svolgimento della principale manifestazione della città che si svolge ogni Ferragosto lungo corso Garibaldi: la processione della Vara, una macchina votiva tirata a braccia e tanto alta da essere ostacolata dalla linea aerea del tram.
In corso d'opera è stato dunque necessario spostare il tracciato da corso Garibaldi a via Vittorio Emanuele: la linea tranviaria è stata costruita lungo via I Settembre solo fino la dogana superata la quale i binari occupano la parte lato monte della via Vittorio Emanuele sino alla Prefettura (piazza Unità d'Italia) per poi proseguire lungo viale della Libertà (lato mare) sino l'incrocio con viale Giostra. La variante non ha comunque impedito di continuare a servire dei punti strategici per il servizio tranviario come il Municipio e la zona del Duomo, un'area con molti istituti scolastici, il teatro Vittorio Emanuele e la Fiera.